Mesmo existindo rumores que os Grox tenham criado a federação, quando você se alia a eles, todos os outros impérios declararão guerra contra você.
Embora não exista uma capital ou uma sede de poder, a galáxia possui uma federação organizada, que abrange todas as civilizações inteligentes como membros. Não se sabe exatamente qual o real poder que a Federação Galáctica possui em toda a galáxia. A única lei oficial que se aplica é o Código Galáctico, que impede o uso de armas nucleares ou de destruição em massa em planetas que se localizam em setores onde há vida. A Federação Galáctica não possui um líder, embora várias civilizações afirmem que os Grox criaram e controlam a Federação Galáctica, o que é improvavel pois quando você faz coisa errada você ganha pontos de relacionamento com eles. Outra teoria, mais provável, é de que os cavaleiros criaram a Federação, já que eles seguem a filosofia da lei. Isso explicaria por que os Grox gostam quando o código galáctico é violado, já que eles são eternos inimigos dos cavaleiros e provocaram sua extinção (até o jogador fazê-los ressurgir, tornando-se um cavaleiro). Geralmente, a federação permite que os impérios e civilizações criem suas próprias leis. Por isso, guerras entre civilizações são algo comum e nunca possuem interferência de nenhum tipo de ordem governamental.