Wojna – konflikt zbrojny pomiędzy plemionami, cywilizacjami lub imperiami. Podczas wojen prawie zawsze walczą ze sobą wrogowie. Celem najczęściej jest przejęcie zniszczenie plemienia w fazie plemienia, zdobycie miasta w fazie cywilizacji lub przejęcie planety w fazie kosmosu. W wojnach mamy pewne ułatwienia względem rywala, ponieważ w każdej fazie mamy dostęp do umiejętności następczych, a w fazie kosmosu mamy wiele bronie, których nie posiadają inne imperia (np. planetobójca). W fazie plemienia można zakończyć wojnę dając podarunek, w fazie cywilizacji i kosmosu możemy zakończyć dając sowite odszkodowanie rywalowi. Wróg może sam prosić o pokój. Wtedy decyzja zakończeniu konfliktu należy do nas. Zakończyć wojnę może również klęska którejś ze stron. Z walki słynął głównie agresywne plemiona, wojskowe i religijne cywilizacje oraz Wojownicy, Gorliwcy i Imperium Groksowie w fazie kosmosu. Przed wojną z dużym imperium należy się przygotować. Szczególnie dotyczy to Groksów, którzy są najsilniejszym i największym imperium w galaktyce (Chyba że zdobędziemy więcej niż 2500 układów i ponad 3500 planet - wtedy my będziemy najwięksi). W fazie plemienia prowadzenie wojen może sprawiać kłopot, bo jeśli mamy dwóch wrogów, to możemy mieć sytuację, w której atakują nas dwa plemiona, albo inną nieciekawy układ, kiedy my nacieramy na jakąś wioskę, podczas gdy druga atakuje naszą, która jest w tym czasie pusta. W fazie cywilizacji, jeżeli mamy jedne albo dwa miasta i kiedy atakujemy jakieś inne miasto silnej cywilizacji, musimy je zdobyć, ponieważ jeśli nam się to nie uda, możemy spodziewać się mocnej odpowiedzi, która może się zakończyć nawet zniszczeniem naszego narodu.